Училище за професионално и продължаващо обучение

Анотация и цели на курса

 

Записалите курса ще научат основни понятия за анализ на геномни данни, метагеномика и микробиомен анализ с помощта на онлайн платформи като Galaxy и Microbiome Analyst. Ще се разгледат основните етапи на секвениране, анотация на геноми, функционален анализ и биостатистически подходи за интерпретация на микробиомни данни. Курсът ще запознае студентите с основните инструменти за анализ на метагеномни данни, процесите на качествен контрол на секвенирането, филтриране на данни, таксономична класификация и функционално профилиране на микробиоми. Ще се разгледат биоинформатични платформи и облачни среди за работа с големи геномни и микробиомни набори от данни.

 

Теми разглеждани в курса:

 

  

ТЕМАТИЧЕН ПЛАН
№ на занятие	Заглавие на тема	Форма на преподаване		Брой часове аудиторни		Брой часове сам. раб.
1	Въведение в биоинформатиката и онлайн платформите	Лекция		1		0
2	Запознаване с платформата Galaxy и основните инструменти	Лекция и демонстрация		3		1
3	Подготовка на данни за анализ – QC и филтриране	Практическо занятие		3		2
4	Анотация и анализ на геномни последователности	Практическо занятие		3		2
5	Метагеномен анализ с Microbiome Analyst	Практическо занятие		2		3
6	Таксономична и функционална класификация на микробиоми	Практическо занятие		2		3
7	Интерпретация на микробиомни резултати и визуализация	Практическо занятие		1		4
Общо часове: 30			15		15

 

 

КОМПЕТЕНЦИИ 

 

1) знаят:

•  Основни методи за анализ на геномни и микробиомни данни

 

2) могат:

 

• Използване на онлайн платформи за анализ на биологични данни
• Анализират реални биологични секвенционни данни
• Интерпретация и визуализация на биоинформатични резултати

 

 

ПРЕДВАРИТЕЛНИ ИЗИСКВАНИЯ

 

Курсистите да имат знания и/или умения:

 

• Основни биологични и молекулярно-биологични концепции
• Работа с компютърни среда 

 

 

 ПРЕПОРЪЧИТЕЛНА ЛИТЕРАТУРА

 

1. Pevsner, J. (2015). Bioinformatics and Functional Genomics. Wiley-Blackwell.
2. Quince, C., Shotgun, M., & Nichols, B. (2020). Microbiome Analysis Methods. Nature Reviews Microbiology.
3. Caporaso, J. G., Lauber, C. L., Walters, W. A., et al. (2010). QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data. Nature Methods.

 

 

 

Лектори:  гл. ас. Йордан Ходжев

               

 

ОБРАЗОВАНИЕ:

• 2006 - Магистър по Биофизика, Биологически факултет, Софийски университет „Св. Климент Охридски”, България
• 2004 - Бакалавър по Молекулярна биология, Софийски университет „Св. Климент Охридски”, България
• 2024 - Докторска степен, Национален център по заразни и паразитни болести, отдел Микробиология

Академични позиции през последните пет години

• Пост-докторант в Национален център по заразни и паразитни болести, отдел Микробиология, сектор Микробиом от 19.04.2024
• Докторант в Национален център по заразни и паразитни болести, отдел Микробиология, сектор Микробиом от 13.10.2020
• Молекулярен биолог в Национален център по заразни и паразитни болести, отдел Микробиология, сектор Микробиом от 16.11.2020
• Научен сътрудник в Институт по почвознание, агротехнологии и защита на растенията "Никола Пушкаров", ноември 2017 – октомври 2019

 

 

 

 

Курсът е с продължителност 30 часа, и ще се проведе при сформирана група от 7 човека на посочените дати:

 

28.07 - 01.08.2025 г. - 10.00 до 16.00 ч. 

 

 

Учебна такса:  600 лв. - редовна такса

                         300 лв. - студенти и кандидат-студенти на НБУ

                         

                        

 

 

Краен срок за записване: 18.07.2025 г.

 

 

 

ЗАПИСВАНЕ:

 

1. Свалете бланка от ТУК
2. Попълнете я и я изпратете на: uppo@nbu.bg 
3. В ДОПЪЛНЕНИЕ ще бъде предоставена информация за ПЛАЩАНЕ.

 

За доп. информация и записване:

Център за професионално и продължаващо обучение (ЦППО)

гр. София, НБУ, ул. “Монтевидео“ 21, Корпус 2, Офис 108

Тел.:  02/ 8110 110 (опция 6), 02/ 8110 108

E-mail:  uppo@nbu.bg